色譜柱的選擇
液相色譜儀基質的選擇大致遵循以下法則，硅膠基質的填料被用于大部分的HPLC分析，尤其是小分子量的被分析物，聚合物填料用于大分子量的被分析物質，主要用來制成分子排阻和離子交換柱。
色譜柱在使用前，最好進行柱的性能測試，并將結果保存起來，作為今后評價柱性能變化的參考。在做柱性能測試時要按照色譜柱出廠報告中的條件進行(出廠測試所使用的條件是最佳條件)，只有這樣，測得的結果才有可比性。但要注意：柱性能可能由于所使用的樣品、流動相、柱溫等條件的差異而有所不同。
色譜柱的維護
一、 色譜柱的平衡
反相色譜柱由工廠測試后是保存在乙腈/水中的。新柱應先使用10-20倍柱體積的甲醇或乙腈沖洗色譜柱。請一定確保您分析樣品所使用的流動相和乙腈/水互溶。每天用足夠的時間以流動相來平衡色譜柱，您就會在處理問題方面獲得最大的"補償"。
二、色譜柱的再生
長期使用的色譜柱，往往柱效會下降(柱子的理論塔板數減低)?？梢詫ιV柱進行再生，在有條件的實驗室應使用一個廉價的泵進行柱子的再生。建議用來沖洗柱子的溶劑體積。
三、 色譜柱的維護
使用預柱保護分析柱(硅膠在極性流動相/離子性流動相中有一定的溶解度) 大多數反相色譜柱的pH穩定范圍是2-7.5，盡量不超過該色譜柱的pH范圍 避免流動相組成及極性的劇烈變化 如果使用極性或離子性的緩沖溶液作流動相，應在實驗完畢柱子沖洗干凈，并保存于甲醇或乙腈中 氯化物的溶劑對其有一定的腐蝕性，故使用時要注意，柱及連接管內不能長時間存留此類溶劑，以避免腐蝕。 流動相使用前必須經脫氣和過濾處理